قصة مسلسل الأزهار الحزينة تدور أحداث قصة مسلسل الأزهار الحزينة حول خمس فتيات من الميتم اللواتي يبلغن من العمر 16 عام، يُقمن معًا بنفس الغرفة في ميتم يدعى كوشو يولو في اسطنبول ، ويقع هذا الميتم في وسط حي الأغنياء ، تحب الفتيات بعضهن البعض بشكلٍ كبير، ويساعدن بعضهم دائمًا في الكثير من الأمور، وهذا الأمر الذي ميّز علاقتهن عن علاقات الصداقة الأخرى . ينتقلن إلى مدرسة خاصة واحدة إثر مشكلة حصلت بينهن وبين شباب أثرياء ، اتهم فيها الشباب الأغنياء الفتيات أنهن قمن بالتحرش بهم ، ولكن بعد ذلك يثبت العكس ، فتضطر إحدى أمهات الشبان بإدخال الفتيات إلى المدرسة الخاصة لتغطية فعلة الأولاد وحمايتهم وعد التشهير بهم، والحفاظ على سمعة الأسرة.